Usagi Tsukino vẫn đang phải vật lộn để cân bằng cuộc sống ở quê nhà với nhiệm vụ trở thành Thủy thủ Mặt trăng, người bảo vệ tình yêu và công lý. Cùng với các Sailor Guardians khác và bạn trai của cô, Mamoru Chiba, họ bắt đầu điều tra các trường hợp học sinh từ Học viện Mugen, ngôi trường dành cho những học sinh ưu tú nhất, những người đang bị biến thành quái vật. Trong quá trình điều tra, họ gặp ba cá nhân kỳ lạ: Haruka Tenou, một tay đua xe đẹp trai; Michiru Kaiou, một nghệ sĩ vĩ cầm tài năng; và Hotaru Tomoe, một cô gái bí ẩn với thể chất yếu ớt.
Khi nhiều sự cố xảy ra hơn, các Sailor Guardians lại gặp phải một bất ngờ khác - sự xuất hiện của hai người bảo vệ hành tinh mới với động cơ của riêng họ. Bất chấp lòng trung thành đáng nghi ngờ của những người mới đến Usagi và đồng đội của cô ấy, tất cả họ đều phải đối mặt với mối đe dọa từ kẻ thù chung: một thực thể xấu xa tự xưng là Pharaoh 90.