Tehran Season 3 tiếp tục sau những sự kiện căng thẳng ở cuối mùa 2, khi Tamar Rabinyan — một nhân viên Mossad kiêm hacker gốc Do Thái Iran — rơi vào thế bị săn đuổi cả bởi Mossad lẫn các lực lượng Iran. Cô không còn an toàn với bất kỳ bên nào và phải tìm cách tự cứu mình ở một Tehran đầy cạm bẫy.