Natsume Yuujinchou San theo chân Takashi Natsume, một cậu bé có khả năng nhìn thấy yêu quái. Natsume và cận vệ của anh ấy, Madara, biệt danh là Nyanko-sensei, tiếp tục nhiệm vụ giải phóng yêu quái khỏi hợp đồng của họ trong "Book of Friends."
Natsume chấp nhận khả năng nhìn thấy yêu quái của mình và ngừng nghĩ nó như một lời nguyền. Khi dành nhiều thời gian hơn cho những người bạn là con người và yêu quái của mình, anh ấy nhận ra rằng anh ấy coi trọng cả hai như thế nào và quyết định rằng anh ấy không cần phải lựa chọn giữa linh hồn và thế giới con người để được hạnh phúc.