Các cô gái trẻ của Mitakihara vui vẻ sống cuộc sống của họ, thỉnh thoảng chiến đấu chống lại cái ác, nhưng nếu không thì vẫn tiếp tục cuộc sống yên bình hàng ngày của họ. Tuy nhiên, Homura Akemi cảm thấy có điều gì đó không ổn trong bầu không khí dễ chịu bất thường này mặc dù những người khác vẫn phớt lờ, nhưng cô không thể không nghi ngờ rằng có nhiều điều đang diễn ra hơn là nhìn bằng mắt thường: một người không nên tồn tại hiện đang có mặt. để tham gia vào các hoạt động của họ.
Mahou Shoujo Madoka★Magica Movie 3: Hangyaku no Monogatari theo chân Homura trong cuộc đấu tranh của cô ấy để khám phá ra sự thật đau lòng đằng sau những hoàn cảnh bí ẩn, khi cô ấy ích kỷ và tuyệt vọng chiến đấu vì tình yêu bất diệt của mình trong phần kết đầy tuyệt vọng của câu chuyện về năm người những cô gái phép thuật.