Phép thuật không có thật mọi người đều biết điều đó. Tuy nhiên, khi được thực hiện bởi một chuyên gia thực sự, ảo thuật sở hữu khả năng khiến khán giả kinh ngạc và ngạc nhiên. Kaito Kuroba, con trai của ảo thuật gia sân khấu nổi tiếng thế giới Touichi Kuroba, không xa lạ gì với sự thật này. Thông thạo nghệ thuật đánh lừa và đánh lạc hướng, Kaito thường xuyên phá rối cuộc sống của những người xung quanh bằng những mánh khóe và trò đùa hào nhoáng. Nhưng khi Kaito vô tình đi vào một lối đi bí mật trong nhà của mình, anh phát hiện ra một bí mật có thể là nguyên nhân cái chết của cha anh tám năm trước - bộ trang phục màu trắng chim bồ câu của Kid the Phantom Thief. Vì muốn tìm hiểu thêm về cha mình, Kaito mặc trang phục và tìm kiếm Viên ngọc Pandora được cho là có thể ban cho sự bất tử. Tuy nhiên, anh ta không phải là người duy nhất theo đuổi viên ngọc tổ chức chịu trách nhiệm về cái chết của cha anh ta cũng đang theo dõi anh ta!
Magic Kaito kể về sự tái sinh của Kaitou Kid, tên trộm bóng ma của bóng đêm. Sử dụng hình nộm, cải trang và khẩu súng thẻ đặc trưng của mình, Kaito bắt đầu đánh cắp những viên ngọc quý nhất thế giới, khám phá ra sự thật đằng sau cái chết của cha mình và Viên ngọc Pandora được đồn đại trên đường đi.