Ẩn mình trong những ngọn núi gần trường Trung học Kunugigaoka ưu tú là một tòa nhà nhỏ vô chủ, nơi chứa những đứa trẻ phạm pháp và học sinh bỏ học của Lớp 3-E. Bị các bạn đồng trang lứa coi thường, học sinh trong lớp này dường như không có chút hy vọng nào trong việc thăng tiến trong sự nghiệp học tập của mình. Đó là, cho đến khi chính phủ quốc gia giao nhiệm vụ cho họ loại bỏ mối đe dọa lớn nhất đối với hành tinh của họ: giáo viên mới của họ.
Đã từng phá hủy mặt trăng, vị giáo sư giống bạch tuộc - được mệnh danh là "Koro-sensei" - giờ đe dọa sẽ hủy diệt Trái đất vào tháng 3 năm sau. Vì nhiệm vụ của mình, các sinh viên nhận thấy rằng giết anh ta nói thì dễ hơn làm. Koro-sensei không chỉ có thể di chuyển với tốc độ lên tới Mach 20 mà còn có thể chống lại hầu hết mọi vũ khí trên đất. Trớ trêu thay, anh ấy cũng chứng tỏ mình là một trong những giáo viên giỏi nhất mà Lớp 3-E từng có. Huấn luyện cả lớp thành tích học tập và kỹ năng làm sát thủ, Koro-sensei tự tin rằng sự khéo léo và ý chí bất khuất của học sinh có thể đưa họ trở lại trường chính.
Thông qua thử nghiệm và sai lầm, Nagisa Shiota, cũng như các học sinh khác của Lớp 3-E, phải tìm ra điểm yếu của Koro-sensei — và nhanh chóng, vì số phận của thế giới phụ thuộc vào nó.