Sau các sự kiện của Satsujin Kousatsu (Zen), Shiki Ryougi đã hôn mê trong hai năm do tai nạn giao thông. Cuối cùng khi tỉnh dậy, cô không còn ký ức về quá khứ của mình và bị ám ảnh bởi một nỗi cô đơn sâu sắc. Kỳ lạ hơn nữa, cô ấy nhận thấy những đường tối bao quanh những thứ xung quanh mình và nếu chạm vào chúng, cô ấy có thể tháo rời đồ vật thứ khiến cô ấy hoàn toàn kinh hãi. Bạn của cô, Mikiya Kokutou, nhờ sự giúp đỡ của Touko Aozaki, một pháp sư có thể giúp Shiki hiểu được đôi mắt của cô "Mystic Eyes of Death Perception" thực sự có khả năng và cách sử dụng chúng đúng cách.
