Mega Shark vs. Kolossus kể về việc Nga tìm kiếm một nguồn năng lượng mới, vô tình kích hoạt lại Kolossus - một người máy khổng lồ từ thời Chiến tranh Lạnh có thể mang đến ngày tận thế. Cùng lúc đó, một Mega Shark mới xuất hiện, đe dọa an ninh toàn cầu.