Sau nhiều năm chiến tranh không có kết quả giữa bốn vương quốc Gamindustri (Planeptune, Lastation, Lowee và Leanbox) về Chia sẻ năng lượng, nguồn sức mạnh của họ dựa trên việc người dân của họ có niềm tin vào các nữ thần của họ đến mức nào, cuối cùng bốn CPU cai trị họ cũng đã ký hiệp ước hữu nghị. Hiệp ước cấm bất kỳ nỗ lực nào nhằm tuyên bố Chia sẻ năng lượng thông qua lực lượng quân sự, với hy vọng mang lại hòa bình và thịnh vượng cho thế giới của họ. Tuy nhiên, một tháng sau hiệp ước, Neptune, Nữ thần CPU của Planeptune, dành thời gian của mình để chơi game hơn là làm công việc của mình, khiến Cổ phiếu của vùng đất của cô giảm mạnh.
Trò chơi Choujigen Neptune The Animation theo chân Neptune và những người bạn của cô ấy cố gắng nâng cao Cổ phần, đồng thời đối phó với một mối đe dọa bên ngoài có thể đánh dấu sự kết thúc của cả hai Nữ thần và Gamindustri ...